Enfant, Yamato apprend de la bouche d’un vieil inspecteur agonisant que son père est l’auteur du fameux vol des 300 millions de yens. En 2010, le garçon découvre, dans une pièce de l’armure de kendo de son père, un ancien billet de 500 yens qui, selon lui, fait partie du butin. Quelques joursplus tard, les Odagiri, ses parents adoptifs, disparaissent mystérieusement. De plus, après avoir été injustement accusé d’assassinat, le garçon est obligé de prendre la fuite avec Miku, la fille des Odagiri. 
Yamato et Miku se rapprochent progressivement de la vérité… Ils rencontrent Kyôko Gibson, qui fait partie des auteurs du vol. Par ailleurs, Harry, un ex-militaire américain semble savoir ce qu’est devenu Ryû, l’ancien amoureux de Kyôko.