2358. Comme des milliers d'autres gamins, le jeune Tetsurô Hoshino tente d'échapper à la misère dans les bas-fonds de Mégalopolis et, depuis que sa mère a été tuée par le Comte Mécanique, le plus redoutable des cyborgs, lors d une chasse aux humains, son obsession est de venger sa mort. Mais afin de châtier le meurtrier, il lui faut devenir lui-même un cyborg. Le seul moyen d'y parvenir est d'embarquer à bord du Galaxy Express pour atteindre la planète Andromède où il pourra obtenir un corps d androïde. Hélas, le voyage est loin d être gratuit! Voici cependant qu une mystérieuse jeune femme dénommée Maetel lui offre la possibilité d'obtenir un billet gratuit à condition qu il l'accompagne jusqu au terminus où son objectif se concrétisera.

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